Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms