Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms