Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms