Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
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