Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PLNP26678 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms