Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms