Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA4P25789 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA4P25789 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA4P25789 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA4P25789 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA4P25789 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA4P25789 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA4P25789 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA4P25789 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA4P25789 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms