Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APCP25054 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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