Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYF6P23409 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYF6P23409 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MYF6P23409 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms