Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms