Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DESP17661 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DESP17661 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms