Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDGFRAP16234 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms