Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT10P13645 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT10P13645 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms