Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT3P12035 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT3P12035 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT3P12035 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT3P12035 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT3P12035 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms