Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms