Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFPTP0C1Z6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms