Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTCP00480 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTCP00480 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTCP00480 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms