Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms