Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms