Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXTL3O43909 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms