Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX1O43812 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX1O43812 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX1O43812 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX1O43812 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX1O43812 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms