Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms