Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NDUFS4O43181 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NDUFS4O43181 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NDUFS4O43181 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NDUFS4O43181 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NDUFS4O43181 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NDUFS4O43181 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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