Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms