Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms