Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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