Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms