Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EFCAB5A4FU69 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms