Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms