Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms