Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms