Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms