Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms