Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms