Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SATB2Q9UPW6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms