Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms