Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms