Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms