Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms