Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms