Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FBXL12Q9NXK8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL12Q9NXK8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms