Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms