Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM60AQ9NP50 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM60AQ9NP50 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM60AQ9NP50 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM60AQ9NP50 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM60AQ9NP50 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM60AQ9NP50 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM60AQ9NP50 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM60AQ9NP50 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM60AQ9NP50 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM60AQ9NP50 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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