Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms