Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM27Q9HBJ8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms