Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms