Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPATA16Q9BXB7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms