Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms