Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms