Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms